Торжественное освящение Богоявленского собора состоялось 25 сентября 1746 года.
Собор Богоявления (наряду со Спасской церковью и собором в Нерчинске) является одним из старейших каменных зданий Восточной Сибири и Дальнего Востока.
В отличие от Спасской церкви, пожар 1879 года не стал угрозой для Собора Богоявления: пламя остановилось прямо у ворот.
Храм неоднократно подвергался различным повреждениям из-за природных катаклизмов: землетрясений и бурь.
Собор Богоявления — традиционное место открытия фестиваля «Сияние России» в Иркутске.