Озеро Ая – один из немногих горно-алтайских природных водоёмов, где летом можно купаться в воде комфортной температуры.
Питается озеро исключительно дождями и родниковыми водами.
На дне озера имеется слой сероводорода, так называемая сероводородная подушка. Наличие подушки роднит пресноводную Аю с Чёрным Морем.
"Ая" в алтайской мифологии – это луна.
И озеро Ая и посёлок Ая имеют легенды о своём создании, героиней которых выступает именно Ая-луна. Так, происхождение озера объясняется желанием демиурга Аи-луны спасти человечество от злодея-людоеда. Луна спрыгнула на землю, крепко впечатавшись в землю при падении. Конечно, злодей был наказан, а отпечаток луны стал озером.